לאחר שלבי התכנון השונים, מגיע הרגע להקים את הגינה ולהביא את הרעיון למציאות. הקמת גינות מעוצבות במרפסת מבוצעת לרב לפי מספר שלביים עיקריים:

1. בחירת האדמה הנכונה – הבסיס לכל מרפסת גינה מעוצבת ובריאה הוא אדמה איכותית. בעת בחירת אדמה לגינת מרפסת, יש להעדיף תערובות אדמה קלות ואווריריות. תערובות אלו מאפשרות ניקוז טוב של המים, חיוניות להתפתחות שורשי הצמחים, ומאפשרות לאדמה "לנשום". חשוב לוודא שהאדמה עשירה בחומרים אורגניים, המספקים לצמחים את כל חומרי ההזנה הדרושים להם.
2. גודל המיכל – לכל צמח נדרש גודל אחר של מיכל, כך שצמחים גדולים דורשים מכלים גדולים יותר, בעוד שצמחים קטנים יכולים להסתפק בעציצים קטנים. גודל העציץ משפיע ישירות על התפתחות שורשי הצמח, על כמות המים והדשן שהוא מקבל ועל יציבותו הכללית, ולכן חשוב לבחור את המיכל המתאים.
3. בחירת הצמחים המתאימים – בחירת הצמחים היא שלב קריטי בעיצוב הגינה. יש להתחשב במספר גורמים:                                                                                                                      כמות אור השמש – ישנם צמחים אוהבי שמש וישנם צמחים המעדיפים צל, לכן חשוב להתאים את הצמחים לכמות האור הזמינה במרפסת ולמקם אותם בהתאם.                          תנאי האקלים – חשוב לבחור צמחים המתאימים לתנאי האקלים באזור המגורים, בין אם שמשי מאד או מאופיין ברוחות חזקות.                                                                              תחזוקה – כאשר בוחרים צמחים לגינת מרפסת, יש לשקול את כמות הזמן שמוכנים להשקיע בטיפול בהם. ישנם צמחים הדורשים השקיה תכופה וגיזום, בעוד שצמחים אחרים עשויים להיות עמידים יותר ולהזדקק לפחות תשומת לב.
4. שילובים וסגנונות – ניתן לבחור גינה בסגנון מסוים, לסדר ערוגות לפי סוג הצמחים או לשלב כמה סוגי צמחים יחדיו:

• עשבי תיבול – בזיליקום, רוזמרין, טימין, נענע, כוסברה – מצוינים להכנת מאכלים ומוסיפים ארומה נפלאה למרפסת.
• פרחים עונתיים – פטוניות, גרניום, ציפורני חתול, אמנון ותמר – פורחים בשלל צבעים וממלאים את המרפסת בשמחה.
• צמחים בשרניים – קקטוסים, סוקולנטים, אלוורה – עמידים לתנאי יובש ודורשים מעט מאוד טיפול.
• צמחים מטפסים – קיסוס, ויסטריה, פנדוריאה – מעולים כצמחים לכיסוי קירות ומעקות, ויוצרים מראה ירוק ושופע.